Ο ΠΑΟΠ Ν. Αμισού Β’ ιδρύθηκε το 2018 και αποτελεί την δεύτερη ομάδα της Νέας Αμισού.
Η ομάδα αυτή δημιουργήθηκε με σκοπό να αγωνίζονται νέοι ποδοσφαιριστές και έπειτα να προωθούνται στην ανδρική ομάδα.
Την πρώτη της σεζόν έλαβε μέρος στον πρώτο όμιλο της Β’ κατηγορίας με προπονητή τον κ. Μουρατίδη και παίκτες από τις ακαδημίες του ΠΑΟΠ. Η ομάδα προσπάθησε να παίξει όμορφο ποδόσφαιρο και να αναδείξει τα ταλέντα της. Λίγο πριν το τέλος της σεζόν προπονητής ανέλαβε ο κ. Χοροζίδης. Εν τέλει η ομάδα τερμάτισε στην 10η θέση του ομίλου της με την απειρία των παιδιών να φαίνεται σε αρκετά σημεία στον αγωνιστικό χώρο. Παρόλα αυτά το ταλέντο της ομάδος δεν έμεινε κρυφό.
Τη φετινή σεζόν η ομάδα ξεκίνησε με προπονητή τον Ιορδάνη Θεοδοσιάδη και αγωνίστηκε στον δεύτερο όμιλο. Ο ΠΑΟΠ, έχοντας συγκεντρώσει εμπειρίες από την περσινή σεζόν, βελτιώθηκε αισθητά. Αξίζει να σημειωθεί ότι η ομάδα συγκέντρωσε περισσότερους βαθμούς σε λιγότερες αγωνιστικές σε σχέση με την προηγούμενη χρονιά. Η οριστική διακοπή του πρωταθλήματος βρήκε την Ν. Αμισό στην μέση της βαθμολογίας με 21 πόντους. Τέλος, η ανδρική ομάδα χρησιμοποίησε αρκετούς ποδοσφαιριστές από την δεύτερή της, δείγμα της σωστής δουλειάς που γίνεται στα τμήματα υποδομής του ΠΑΟΠ.